Insiden operasional di Stasiun Bekasi Timur, wilayah KAI Daop 1 Jakarta, berdampak luas terhadap perjalanan kereta api nasional, termasuk layanan di wilayah PT KAI Daop 7 Madiun pada Selasa (28/4/2026). Sejumlah perjalanan mengalami keterlambatan hingga pembatalan, sementara pelanggan diberikan opsi pengembalian tiket secara penuh. KAI menyampaikan bahwa penyesuaian pola operasi dilakukan untuk mendukung proses evakuasi dan penanganan korban. Salah satu dampak utama adalah penghentian sementara seluruh perjalanan kereta api jarak jauh yang berangkat dari Stasiun Gambir dan Stasiun Pasar Senen, yang berimbas pada keterlambatan perjalanan di berbagai daerah. “Bagi para pelanggan yang terdampak atau KA-nya dibatalkan, dapat melakukan pembatalan tiket di stasiun-stasiun keberangkatan dengan pengembalian biaya sebesar 100 persen”.