Madrasah Aliyah Negeri (MAN) 2 Kota Madiun menjadi salah satu pilihan bagi lulusan SMP maupun Tsanawiyah yang ingin melanjutkan pendidikan. Sekolah ini menawarkan program utama pendalaman agama serta sistem pembelajaran berbasis Sistem Kredit Semester (SKS). “Di sini kita menggunakan SKS dalam proses pembelajarannya sehingga mereka yang ingin percepatan bisa dilakukan”. “Kita mempunyai program IPA, IPS dan Agama. Dan ada juga Diversifikasi layanan. Ini beda dengan program lho ya”. “Untuk jadwal pendaftaran saat ini kita sama dengan SMA maupun SMK, tapi nanti kita juga membuka pendaftaran secara offline bagi anak-anak yang tidak bisa masuk di sekolah pilihannya”.